বর্তমানে মজার ইশকুলের “এডুকেশন প্রোগ্রাম” এর আওতায় ফেইজ-০১; খোলা আকাশের নিচে পরিচালিত ইশকুলে সুবিধাবঞ্চিত পথশিশুদের অনআনুষ্ঠানিক শিক্ষা এবং ফেইজ-০২; স্থায়ী ইশকুলে সুবিধাবঞ্চিত শিশুদের জন্য প্রাতিষ্ঠানিক শিক্ষা কার্যক্রম পরিচালিত করছে।

ফেইজ-০১; খোলা আকশের নিচে পরিচালিত ইশকুলে সপ্তাহে নির্ধারিত ১ দিন স্বেচ্ছাসেবী দ্বারা শিশুদের স্বাক্ষরতা, অক্ষরজ্ঞান, নৈতিক শিক্ষা, স্বাস্থ্য সচেতনতা, সহ-ক্রমিক কার্যবলি শেখানো হয়। এখানে শিক্ষার্থীদের সিলেবাস শেষ করা বা সার্টিফিকেট অর্জনের কোন চাপ থাকে না। তাদের শেখাকে করে তোলা হয় আনন্দময় ও বাস্তবভিত্তিক। এ ধাপে শিশুদের অনুষ্ঠানিক শিক্ষা গ্রহণের জন্য প্রস্তুত করা হয়।
মজার ইশকুলঃ শহবাগ, মজার ইশকুলঃ কমলাপুর, মজার ইশকুলঃ সদরঘাট ও মজার ইশকুলঃ ধানমন্ডিতে প্রতি মাসে প্রায় ১,০০০ সুবিধাবঞ্চিত পথশিশু খোলা আকশের নিচে পরিচালিত ইশকুলের আওতায় অনানুষ্ঠানিক শিক্ষা গ্রহণ করছে।

ফেইজ-০২; রাজধানী ঢাকায় অবস্থিত স্থায়ী ইশকুলে শিক্ষার্থীদের সপ্তাহে ৫ দিন (রবিবার থেকে বৃহস্পতিবার) প্রশিক্ষিত, অভিজ্ঞ শিক্ষক দ্বারা জাতীয় শিক্ষাক্রম ও সুনির্দিষ্ট পাঠ্যক্রমানুসারে শিক্ষা প্রদান করা হয়। এখানে নির্দিষ্ট সময় পর পর শিখন-শিক্ষন প্রক্রিয়ার মান উন্নয়নের জন্য মূল্যায়ন পরীক্ষা নেওয়া হয়। বর্তমানে মজার ইশকুলঃ আগারাগাঁও ও মজার ইশকুলঃ মানিকনগরে যথাক্রমে ১০০ ও ৩০০ জন সুবিধাবঞ্চিত শিশু প্রাতিষ্ঠানিক শিক্ষা গ্রহণ করছে।

ফেইজ-০৩; রাজধানী ঢাকার বাহিরে প্রতন্ত্য অঞ্চলে স্থায়ী ইশকুলে ফেইজ-০২ অনুসারে শিক্ষার্থীদের জাতীয় শিক্ষাক্রম ও সুনির্দিষ্ট পাঠ্যক্রমানুসারে শিক্ষা প্রদান করা হয়। ২০১৯ সালে বরিশাল বিভাগের দ্বীপজেলা ভোলার মনপুরার উপজেলার দক্ষিণ সাকুচিয়া ও কাজির চরের ১০০ সুবিধাবঞ্চিত শিশুকে নিয়ে মজার ইশকুলঃ মনপুরা-১ ও মজার ইশকুলঃ মনপুরা-২ এর কার্যক্রম শুরু করা হয়।
উল্লেখ্য যে কাজিরচড়ে প্রায় ৫০০ পরিবার বসবাসরত থাকা সত্ত্বেও সরকারি বা ব্যক্তিগত উদ্যোগে কোন শিক্ষা প্রতিষ্ঠান পরিচালিত হচ্ছে না মজার ইশকুলঃ মনপুরা -২ ই এখানের প্রথম শিক্ষা প্রতিষ্ঠান।
বর্তমানে মজার ইশকুলের “এডুকেশন প্রোগ্রাম” এর আওতায় পরিচালিত ৮টি ইশকুলের মধ্যে ৪টি খোলা আকশের নিচে পরিচালিত ইশকুলে অনানুষ্ঠানিক ও ৪টি স্থায়ী ইশকুলে জাতীয় শিক্ষাক্রমানুসারে প্রাতিশঠানিক শিক্ষা প্রদান করা হচ্ছে।